قتلگاه امام حسین علیه السلام  معروف به گودال قتلگاه قسمت پایانی سمت چپ رواق جنوب غربی، به وسیله دری به سالن باریکی مرتبط است که در آن یک اتاق 9 متری قرار دارد. این مکان اندکی گود است و دیوارهای آن آیینه کاری و نقاشی شده است.

در همین مکان شریف، فرزند حضرت زهرا سلام الله علیها و نوه رسول خدا صل الله علیه واله وصلم شهید شده است. از این جا دری است که به جای گودتری راه دارد که گویند آن جا محلی است که حضرت سید الشهداء ابا عبدالله الحسین علیه السلام از اسب بر زمین افتاد. اکنون چهار طرف گودال قتلگاه با پنجره‌های فولادی محصور شده و زائران از پشت آن به این مکان شریف نظاره می‌کنند و در غم شهادت فرزند فاطمه  سلام الله علیها به دست دشمن ظالم و کینه‌توز اشک می‌ریزند.